22 апреля 2010 года Федеральной службой по техническому и экспортному контролю (ФСТЭК России) принято решение о проведении сертификации автоматизированной системы управления лекарственным обеспечением населения «М-Аптека» на соответствие требованиям руководящего документа «Защита от несанкционированного доступа к информации. Часть 1. Программное обеспечение средств защиты информации. Классификация по уроню контроля отсутствия недекларированных возможностей» - по 4 уровню контроля и технических условий.